千葉県､ 東京都､ 石川県､ 静岡県､ 三重県､ 和歌山県､ 香川県､ 高知県､ 大分県､ 熊本県､ 沖縄県の2002年夏季のブタ血清を収集し､ ウイルス分離を試みた。ブタ血清は日本脳炎ウイルスIgM抗体が陽性となった時点より､ １週ないし２週前に採取した血清をウイルス分離材料として用いた。
香川(２株：JEV/sw/Kagawa/24/2002, GeneBank accession No.AB112706, JEV/sw/Kagawa/27/2002, GeneBank accession No.AB112707)､ 三重(JEV/sw/Mie/41/2002, GeneBank accession No.AB112709)､ 静岡(２株：JEV/sw/Shizuoka/33/2002, GeneBank accession No. AB112703, JEV/sw/Shizuoka/39/2002, GeneBank accession No.AB112704)､ 千葉(JEV/sw/Chiba/88/2002, GeneBank accession No.AB112705)の分離株に関して､ Ｅ領域の遺伝子解析まで実施した結果､ いずれもワクチン株のIII型とは異なる遺伝子型Ｉ型であった。静岡で分離された２株､ 香川で分離された２株は､ それぞれ全く同じウイルスであった。千葉､ 静岡､ 三重の分離株間のホモロジーは約98〜99％であり､ 香川と静岡の分離株間のホモロジーは97％であったが､ いずれも極めて高いホモロジーを示した。
協力いただいた施設は､ 千葉県衛生研究所､ 東京都健康安全研究センター､ 石川県保健環境センター､ 静岡県西部食肉衛生検査所､ 静岡県環境衛生科学研究所､ 三重県科学技術振興センター保健環境研究部､ 和歌山県環境衛生研究センター､ 香川県環境保健研究センター､ 高知県衛生研究所､ 大分県衛生環境研究センター､ 熊本県保健環境科学研究所､ 沖縄県衛生環境研究所の12施設である。
国立感染症研究所・ウイルス第一部
高崎智彦 根路銘令子 倉根一郎
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