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最近新しく認知され、局知的にあるいは国際的に公衆衛生上の問題となる感染症です。
［例：SARS(重症急性呼吸器症候群)、高病原性鳥インフルエンザ、腸管出血性大腸菌感染症など］

同一の病原体により、ヒトとヒト以外の脊椎動物の双方が罹患する感染症です。
［例：日本脳炎、クリプトスポリジウム症など］

昆虫やダニが病原体を媒介してヒトが罹患する感染症です。
［例：Ｑ熱、ウエストナイル熱/脳炎など］

全血輸血、成分輸血や、血液で汚染された注射器、医療器具などの使用により感染する疾患です。母児感染や性交渉による感染もこれに該当することがあります。
［例：C型肝炎、後天性免疫不全症候群(HIV)など］

通常は蠕虫(いわゆる"ムシ")、原虫(顕微鏡でしか見えない単細胞生物)による疾患ですが、昆虫・ダニによる疾患も含みます。
［アメーバ赤痢、マラリアなど］

すべてが、あるいは主に海外で感染して国内に持ち込まれる感染症です。
［コクシジオイデス症、コレラなど］

病原体が腸管内で増殖して下痢、その他の症状をおこす感染症です。
［細菌性赤痢、腸炎ビブリオ、腸管出血性大腸菌感染症など］

主に小児が罹患する感染症です。
［咽頭結膜熱、手足口病、ヘルパンギーナなど］

結膜炎など、主に眼に症状が出現する感染症です。
［咽頭結膜熱、流行性角結膜炎］

性的接触により罹患する感染症です。
［性器クラミジア感染症、淋菌感染症など］

正常の宿主に対しては病原性を発揮しない病原体が、宿主の抵抗力が弱っている時に病原性を発揮しておこる感染症です。
［サイトメガロウイルス感染症など］

抗菌薬が効きにくくなった、または全く効かなくなった細菌によっておこる感染症です。
［バンコマイシン耐性腸球菌（VRE）感染症、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（MRSA）感染症など］