| 2000年26週（第26号）
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（平成12年6月26日〜7月2日）／手足口病・腸管出血性大腸菌流行状況／病原体情報（Vero毒素産生性大腸菌・無菌性髄膜炎・手足口病・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎）／IASR速報-ウエディングケーキが原因食品となったS.Thompson食中毒事例・埼玉県内産の豚からのインフルエンザウイルス分離／海外感染症情報／読者のコーナー（平成11年度の全数把握対象感染症報告数について）
2000年25週（第25号）
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（平成12年6月19〜25日）／手足口病・腸管出血性大腸菌流行状況／病原体情報（Vero毒素産生性大腸菌・無菌性髄膜炎・手足口病・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎）／IASR速報-インド、東南アジア旅行者からのS.Typhiの検出状況・調理用ミキサーを介したS.Enteritidisによる集団食中毒事例／海外感染症情報／感染症の話（HPS）／読者のコーナー（投稿：牛生レバー喫食後のO157感染発症事例の続発-和歌山市）
2000年24週（第24号）5月報含む
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（平成12年6月12〜18日）／手足口病流行状況／病原体情報（手足口病・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎・Vero毒素産生性大腸菌）／IASR速報-日本人海外旅行者のデングウイルス感染症例・東京都におけるデングウイルス熱患者の発生／海外感染症情報／感染症の話（ラッサ熱）
2000年23週（第23号）
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（平成12年6月5日〜11日）／手足口病流行状況／病原体情報（手足口病・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎・感染性胃腸炎）／IASR速報-手足口病、無菌性髄膜炎患者からのエンテロウイルス71型の分離／海外感染症情報／感染症の話（ヒト後天性免疫不全症候群-後編）／読者のコーナー（感染症新法下の感染症発生動向調査における感染性胃腸炎について）
2000年22週（第22号）
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（平成12年5月29日〜6月4日）／手足口病流行状況／病原体情報（感染性胃腸炎・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎・手足口病）／IASR速報-成田空港検疫所で診断されたデングウイルス感染症例・デング輸入症例の動向（長崎大学）／海外感染症情報／感染症の話（ヒト後天性免疫不全症候群-前編）
2000年21週（第21号）
ダウンロード（27p/774K）
（平成12年5月22日〜28日）／手足口病流行状況／病原体情報（感染性胃腸炎・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎・手足口病）／IASR速報-ホタルイカ生食を原因とする旋尾線虫幼虫移行症の発生状況・旋尾線虫幼虫の検出状況／海外感染症情報
2000年20週（第20号）
ダウンロード（26p/710K）
（平成12年5月15〜21日）／麻疹流行状況／病原体情報（感染性胃腸炎・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎・手足口病）／IASR速報-インフルエンザシーズンにおけるコクサッキーウイルスB5型の散発流行／海外感染症情報／感染症の話（VRE）／読者のコーナー（感染症新法における感染症の分類について）
2000年19週（第19号）4月報含む
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（平成12年5月8〜14日）／麻疹流行状況／病原体情報（感染性胃腸炎・咽頭結膜熱・流行性角結膜炎）／IASR速報-肥育牛におけるEHECO157感染発症事例／海外感染症情報／読者のコーナー（「定点当たり報告数」について）
2000年17・18週（第17・18合併号）
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（平成12年4月24〜30日、5月1〜7日）／麻疹流行状況／病原体情報（感染性胃腸炎・インフルエンザ）／IASR速報-インフルエンザウイルスA香港が鼻汁より分離された急性壊死性脳症患者例／海外感染症情報／感染症の話（梅毒）／読者のコーナー（訂正記事）
2000年16週（第16号）
ダウンロード（27p/645K）
（平成12年4月17〜23日）／麻疹流行状況／病原体情報（感染性胃腸炎・インフルエンザ）／IASR速報-中国へ修学旅行の高校生がEHECO157：H7など複数の下痢原性細菌に集団感染した事例／海外感染症情報／感染症の話（淋菌感染症）／読者のコーナー（国内で分離されている新しい型のレプトスピラに関する情報）
2000年15週（第15号）
ダウンロード（27p/710K）
（平成12年4月10〜16日）／麻疹流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-B型肝炎母子感染防止事業開始後に出生した小児のHBVキャリアー率／海外感染症情報／感染症の話（黄熱）／読者のコーナー（薬剤耐性菌の届出について）
2000年14週（第14号）3月報含む
ダウンロード（34p/710K）
（平成12年4月3〜9日）／麻疹流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-手足口病患者からのエンテロウイルス71型分離状況／海外感染症情報／感染症の話（流行性角結膜炎）
2000年13週（第13号）
ダウンロード（29p/774K）
（平成12年3月27日〜4月2日）／麻疹流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-Shigella flexneri 2aによる保養施設宿泊者の集団感染事例／海外感染症情報／感染症の話（クロイツフェルト・ヤコブ病）
2000年12週（第12号）
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（平成12年3月20〜26日）／麻疹流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-日本のエイズ患者、HIV感染者の状況／海外感染症情報／感染症の話（ジアルジア症）
2000年11週（第11号）
ダウンロード（26p/710K）
（平成12年3月13〜19日）／麻疹流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-B型インフルエンザウイルスの分離（大阪市）／海外感染症情報／感染症の話（性器クラミジア感染症）
2000年10週（第10号）
ダウンロード（26p/839K）
（平成12年3月6〜12日）／インフルエンザ流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-B型インフルエンザウイルスの分離（仙台市）／海外感染症情報／感染症の話（性器ヘルペスウイルス感染症）
2000年9週（第9号）2月報含む
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（平成12年2月28日〜3月5日）／インフルエンザ流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-東京都内で採取されたコロモジラミの殺虫剤感受性の現状／海外感染症情報／感染症の話（日本紅斑熱）
2000年8週（第8号）
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（平成12年2月21〜27日）／インフルエンザ流行状況／病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-東京都内で発生したグリーンオリーブの塩漬けによるB型ボツリヌス食中毒事例／海外感染症情報／感染症の話（ツツガムシ病）
2000年7週（第7号）
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（平成12年2月14〜20日）／インフルエンザ流行状況／ 病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-東京都内で発生した髄膜炎菌性髄膜炎、敗血症等について・仕出し弁当による腸管毒素原性大腸菌O153食中毒集団発生事例／海外感染症情報／感染症の話（先天性風疹症候群）
2000年6週（第6号）
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（平成12年2月7〜13日）／インフルエンザ流行状況／ 病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-老人福祉施設におけるインフルエンザ集団発生・群馬県における1999/2000シーズンのインフルエンザ動向／海外感染症情報／感染症の話（狂犬病）／読者のコーナー（定点把握疾患における定点医療機関について）
2000年5週（第5号）1月報含む
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（平成12年1月31日〜2月6日）／インフルエンザ流行状況／ 病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-保育園における腸管出血性大腸菌Ｏ111集団感染事例・日本のエイズ患者、HIV感染者の状況／海外感染症情報／感染症の話（尖形コンジローム）
2000年4週（第4号）
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（平成12年1月24〜30日）／インフルエンザ流行状況／ 病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-B型インフルエンザウイルス分離（広島県）・小学校で発生した小型球形ウイルスによる嘔吐下痢症／海外感染症情報／感染症の話（Ｑ熱）
2000年3週（第3号）
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（平成12年1月17〜23日）／インフルエンザ流行状況／ 病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-ボルンホルム病の流行（愛知県）・ワイル病による死亡事例（宮城県）／海外感染症情報／感染症の話（ブルセラ症）／読者のコーナー（感染症週報のファイル形式-PDF-について）
2000年2週（第2号）
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（平成12年1月10〜16日）／インフルエンザ流行状況／ 病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-インフルエンザAH1型ウイルス感染による急性脳症（大阪府）・大阪における今冬季RSウイルス動向／海外感染症情報／感染症の話（レジオネラ症）／読者のコーナー（「過去5年間の平均との比」グラフの読み方について）
2000年1週（第1号）
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（平成12年1月3〜9日）／インフルエンザ流行状況／ 病原体情報（インフルエンザ・感染性胃腸炎）／IASR速報-無症状病原体保有者を主としたEHECＯ26集団発生（千葉県）、フィリピンから帰国後のデング熱・ジアルジア症同時発症例／海外感染症情報／感染症の話（コレラ）
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