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2006年26週（第26号）
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（平成18年6月19〜25日）伝染性紅斑・腸管出血性大腸菌感染症／病原体情報（Vero毒素産生性大腸菌・アデノウイルス3型・無菌性髄膜炎）／シラミ症
2006年25週（第25号）
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（平成18年6月19〜25日）手足口病／病原体情報（Vero毒素産生性大腸菌・咽頭結膜熱・ヒトメタニューモウイルス）／海外感染症情報
2006年24週（第24号）*5月報含む
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（平成18年6月12〜18日）インフルエンザ／病原体情報（Vero毒素産生性大腸菌・インフルエンザ・感染性胃腸炎）／速報−高齢者福祉施設におけるヒト・メタニューモウイルス集団感染事例（福岡県）/平成18年度インフルエンザHAワクチン製造株について／海外感染症情報
2006年23週（第23号）
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（平成18年6月4〜11日）ヘルパンギーナ／病原体情報（咽頭結膜熱・Vero毒素産生性大腸菌・インフルエンザ）／速報−Ａ型肝炎ウイルスによる食中毒事例（新潟市・新潟県）／海外感染症情報
2006年22週（第22号）
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（平成18年5月29〜6月4日）A群溶血性レンサ球菌咽頭炎／病原体情報（手足口病・Vero毒素産生性大腸菌・インフルエンザ）／速報−エンテロウイルス71型（EV71）の検出状況（愛知県）／海外感染症情報 ／野兎病
2006年21週（第21号）
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（平成18年5月22〜28日）インフルエンザ／病原体情報（Vero毒素産生性大腸菌・無菌性髄膜炎・インフルエンザ・アデノウイルス）／速報−予防接種法施行令の一部を改正する政令の一部を改正する政令等の概要／インフルエンザ（H5N1）を指定感染症として定める等の政令等の概要／エコーウイルス18型の分離状況（北九州市）／海外感染症情報
2006年20週（第20号）*4月報含む
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（平成18年5月15〜21日）咽頭結膜熱・腸管出血性大腸菌感染症／病原体情報（冬季の感染性胃腸炎関連・インフルエンザウイルス・アデノウイルス）／速報−A型肝炎 2005年（2006年5月26日時点）／海外感染症情報／リッサウイルス感染症
2006年19週（第19号）
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（平成18年5月8日〜14日）麻しん／病原体情報（冬季の感染性胃腸炎関連・インフルエンザウイルス・アデノウイルス）／速報−腸管出血性大腸菌感染症2005年（2006年3月31日時点）／2005/06 シーズン後半におけるB型インフルエンザの集団発生（山口県）／B型インフルエンザウイルスによる中学校における集団発生（埼玉県）／2006年4〜5月におけるB型インフルエンザの地域流行（横浜市）／海外感染症情報
2006年17・18週（合併号）
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（平成18年4月24日〜5月7日）麻しん／病原体情報（インフルエンザウイルス・エンテロウイルス・アデノウイルス・感染性胃腸炎関連）／速報−C群ロタウイルスによる胃腸炎の集団発生事例（岩手県）、大阪府におけるC群ロタウイルスによる集団胃腸炎の発生（大阪府）
2006年16週（第16号）
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（平成18年4月17〜23日）麻しん／病原体情報（冬季の感染性胃腸炎関連・インフルエンザウイルス）／速報−関東における麻疹の集団発生/オウム病 1999年4月〜2006年第12週/県内北部で地域流行が認められた手足口病の患者から検出されたEV71（宮城県）
2006年15週（第15号）*3月報含む
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（平成18年4月10〜16日）A群溶血性レンサ球菌咽頭炎／病原体情報（冬季の感染性胃腸炎関連・インフルエンザウイルス）／海外感染症情報
2006年14週（第14号）
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（平成18年4月3〜9日）咽頭結膜熱／病原体情報（冬季の感染性胃腸炎関連・インフルエンザウイルス）／速報−デング熱 1999年4月〜2006年第12週／サル痘
2006年13週（第13号）
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（平成18年3月27〜4月2日）病原体情報（冬季の感染性胃腸炎関連・インフルエンザウイルス）／速報−コレラ 2005年（2006年3月31日現在）/Genogroup Iのノロウイルスによる小学校における胃腸炎の集団発生事例（新潟県）／海外感染症情報
2006年12週（第12号）
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（平成18年3月20〜26日）流行性耳下腺炎／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／速報−小学校でのC群ロタウイルスによる集団感染事例（島根県）
2006年11週（第11号）*2月報含む
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（平成18年3月13〜19日）水痘／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／海外感染症情報
2006年10週（第10号）
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（平成18年3月6〜12日）A群溶血性レンサ球菌咽頭炎／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／パラチフス 2005年（2006年1月26日時点）／海外感染症情報
2006年9週（第9号）
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（平成18年2月27〜3月5日）インフルエンザ／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／インフルエンザウイルスB型の集団発生について−高知県／海外感染症情報
2006年8週（第8号）
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（平成18年2月20〜26日）インフルエンザ／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／マレーシア、シンガポールへの修学旅行での細菌性赤痢感染事例−神戸市
2006年7週（第7号）*1月報含む
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（平成18年2月13〜19日）インフルエンザ／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／腸チフス 2005年（2006年1月26日時点）／海外感染症情報
2006年6週（第6号）
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（平成18年2月6〜12日）インフルエンザ／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／海外感染症情報
2006年5週（第5号）
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（平成18年1月30〜2月5日）インフルエンザ／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／細菌性赤痢−2005年（2006年1月26日現在）／海外感染症情報
2006年4週（第4号）
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（平成18年1月23〜29日）インフルエンザ・インフルエンザ脳症／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／海外感染症情報
2006年3週（第3号） *12月報含む
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（平成18年1月16〜22日）インフルエンザ・H5N1亜型の鳥インフルエンザの流行状況／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス）／速報−日本のAIDS患者・HIV感染者の状況−エイズ動向委員会委員長コメント（要旨）／海外感染症情報
2006年2週（第2号）
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（平成18年1月9〜15日）インフルエンザ・最近約4カ月間におけるコレラの発生動向／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連）／速報−急性脳炎（03年11月5日〜05年10月27日報告分）／海外感染症情報
2006年1週（第1号）
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（平成18年1月2〜8日）インフルエンザ／病原体情報（インフルエンザ・冬季の感染性胃腸炎関連ウイルス・Vero毒素産生性大腸菌）／アイチウイルスが検出された食中毒事例（大分県)／海外感染症情報
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